Kekurangan lainnya, F-4 tidak dilengkapi kanon (versi awal). Di sinilah, rasio kekalahan pertempuran udara AS terbilang tinggi saat berhadapan dengan MiG-21. Itu dari sisi teknis. Sisi lainnya, pilot-pilot AS kurang dalam hal skill. Hanya satu dua saja yang jago. Itu pun adalah para veteran Perang Korea. Dari sinilah kemudian timbul pemikiran untuk mendirikan sekolah Top Gun.
Di Vietnam, pilot-pilot F-4 seringkali tak bisa melihat datangnya MiG-21. Sementara pilot MiG-21 selalu bisa melihat F-4 yang berukuran lebih besar. Kanopi F-4 bukanlah tipe gelembung (bubble canopy). Sehingga pilot hanya bisa melihat lurus ke depan. Kelemahan ketiga, manuver F-4 sangat payah. Pesawat seperti banteng yang hanya bisa menyeruduk ke depan. Kalau mau melakukan manuver sangat ekstrim, pesawat akan kehilangan daya dorong dan ketinggian yang cukup besar. Kelemahan yang lain, harga dan biaya perawatan pesawat ini sangat tinggi.
